中医学在数千年的历史中，逐渐形成了独特的医学理论体系，标志着中医学作为一门科学的诞生。 中医学理论体系是包括理、法、方、药在内的一个整体，主要阐明中医学的基本理论、基本规律和基本方法。它是以整体观念为主导思想，以气、阴阳、五行诸学说为论理方法，以脏腑经络精气血津液为生理病理基础，以辨证论治为诊治特点的独特的医学理论体系。 医学理论体系的建立，是医学发展成熟的最重要标志。中医学因其在汉代已建立了较完备的医学理论体系，故能代有发展，流传至今。世界各民族都有自己的传统医学，但至今未见衰亡，未被西方医学所替代的，恐怕只有中医学。其原因在于中医学并非简单的传统医学，她具有相当完备的理论体系作指导。医生在治疗疾病时可根据理论分析从未接触过的疾病，这是一般经验医学难以做到的。即使是常见病，中医学也是从辨证入手进行治疗，而不重复以往的经验。当然，理论的正确与否还需要实践的检验，不能有效地指导临床实践的理论则被扬弃。理论源于经验，又反过来指导实践。中医学理论体系就是在这一复杂过程中逐渐完善的。
为什么中医学理论体系形成确立的时期是先秦秦汉时期？
中医学理论体系初步形成于战国至两汉时期，《黄帝内经》、《伤寒杂病论》、《神农本草经》等医学专著的成书，标志着中医学理论体系的初步形成。汉代以后的医学理论与实践的发展，又逐渐充实和完善了这一理论体系。
中医学理论体系的形成和确立，经历了一个漫长的历史时期。战国以降，社会的急剧变革和学术的百家争鸣，为医学理论体系的形成创造了有利的社会文化氛围。
此时，古代医家也加速了对人体自身奥秘及人与自然关系的探讨，力图将医学的经验上升为理论。他们在吸收了诸子学说中的精华部分，在医学实践与解剖学成就的基础上，创立了藏象、经络、气血津液精神等学说，并在探讨人与自然关系的过程中创立了六淫致病学说；
同时又将古代哲学的气、阴阳、五行诸学说引入医学领域，作为方法论用以阐释人体的生理和病理，指导疾病的诊断和防治。于此建立起中医学理论体系。
战国至秦汉时期，是中医学理论体系的形成时期。这一时期问世的《黄帝内经》、《难经》、《伤寒杂病论》、《神农本草经》等医学典籍，标志着中医学理论体系的确立，即理、法、方、药体系的基本形成。
