向税务部门（办税服务厅）申请领用增值税普通发票开具就行。具体怎么开具向当地税务人员或同行学习。
种植合作社销售自己种植的中药材免交增值税及其附加税费。
税务总局公告2018年第29号《关于新办纳税人首次申领增值税发票有关事项的公告》
同时满足下列条件的新办纳税人首次申领增值税发票，主管税务机关应当自受理申请之日起2个工作日内办结，有条件的主管税务机关当日办结：
（一）纳税人的办税人员、法定代表人已经进行实名信息采集和验证（需要采集、验证法定代表人实名信息的纳税人范围由各省税务机关确定）；
（二）纳税人有开具增值税发票需求，主动申领发票；
（三）纳税人按照规定办理税控设备发行等事项。
一般增值税纳税人销售 中药材原料 缴纳增值税 税率是17%还是13%?_百度...
关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知
财税[2009]9号
一、下列货物继续适用13%的增值税税率:
（一）农产品。
农产品,是指种植业、养殖业、林业、牧业、水产业生产的各种植物、动物的初级产品。具体征税范围暂继续按照《财政部国家税务总局关于印发〈农业产品征税范围注释〉的通知》（财税字[1995]52号）及现行相关规定执行。
而农产品中关于药用植物是指：
可用作中药原药的各种植物的根、茎、皮、叶、花、果实等。
利用上述药用植物加工制成的片、丝、块、段等中药饮片，也是本货物的征税范围。
中成药不属于本货物的征税范围。
所以，一般纳税人销售初级农产品，按13%税率征收增值税。
中草药种植合作社开发票是不是免税的
第十五条 下列项目免征增值税： （一）农业生产者销售的自产农产品； （一）企业从事下列项目的所得，免征企业所得税： 1．蔬菜、谷物、薯类、油料、豆类、棉花、麻类、糖料、水果、坚果的种植； 2．农作物新品种的选育； 3．中药材的种植； 4．林木的培育和种植； 5．牲畜、家禽的饲养； 6．林产品的采集； 7．灌溉、农产品初加工、兽医、农技推广、农机作业和维修等农、林、牧、渔服务业项目； 8．远洋捕捞。种植合作社应该是免税的，不过必须经过税务机关批准。
