首先要明确，当地是农田基本保护区吗？如果是――缴税，也不会让你在耕地里搞养殖。基本农田保护区有明文规定：不允许占用耕地搞养殖业。如果不在耕地保护区范围之内，去当地相关部门，申请在耕地搞养殖业。有两种结果如下：
1.如果当地区域，属于重点环境保护区（比如重点水源等）。为了避免造成污染环境，也不会被允许搞养殖业。（绿色养殖业，不在此列，比如水产养殖业。当然，小打小闹也不在此列）。也就谈不上在耕地搞养殖了，更谈不上缴税。
2.不在耕地保护区范围之内，又没有污染环境（比如，山区地广人稀）。像这样的情况下，当地相关部门对于，属于三农产业的小规模养殖，不但不收税，一般都会给予鼓励。有的地区，相关部门还会有相关政策扶持，技术支持等，鼓励新入行的养殖户。（地区不同，养殖产业不同，不能一概而论）。
耕地搞养殖业，主要牵扯当两个方面。一个是当地相关部门的相关政策，另一个是环境污染。当你不触碰这两个主要因素，农户耕地搞小规模养殖没有问题，不牵扯到缴税――等你做到集约化，发展为大规模化的养殖产业，再考虑缴税的问题。
关于耕地能不能搞养殖？我不是土地管理这方面的专家，没法给出准确的回答，但是对于养殖要不要缴税，还可以说一点自己的意见。
养殖业相关税收规定1、养殖业属于农业产品，在增值税征收上适用于9%的税率来进行征收，养殖的产品主要水产品，按照税法规定，可以适用9%税率的是各种动物的初级产品，包括水产品和干制的水产品等等。
2、不过，按照增值税的减免税规定，其中的法定免税项目中就有农业生产者销售的自产农产品项目，这个农产品就是指初级农产品。农业生产者包括从事农业生产的单位和个人，另外对于“公司+农户“经营模式的农业生产者销售自产农产品也是认可的。
所以讲清养殖到底要不要缴税，首先要明确一下养殖的经营主体是什么？是个人？是农民合作社？还是个体户？还是公司？这涉及到缴税的税种和方式是不同的。
这些类型的养殖主体，是否属于免税项目，关键要看是不是只要他们是直接销售养殖的水产品的，不是经过复杂加工的产品的，在增值税上就属于法定的免税项目，不征收增值税。自然也不征收城建税、教育附加了。
3、在所得税方面，一般的公司制企业要缴纳企业所得税，按照企业所得税的规定，进行内陆养殖可以减半征收企业所得税。
举例说明某个公司（小规模纳税人）在农村经营养殖业，并直接销售养殖的水产品，全年的养殖收入为400万元，经过会计核算后的利润为40万元。
那么，按照规定，增值税等是免征的。
在不考虑其它优惠的情况下，企业所得税减半征收，需缴纳的企业所得税=40万×25%×50%=5万元。
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